Avec :
 

• le séquençage complet de l’exome (la partie du génome la plus directement liée à la synthèse des protéines, et donc au phénotype de l'organisme) : pour identifier les fautes d’orthographe au sein du code génétique qui aboutissent à des modifications des protéines produites par les cellules ;
• le séquençage de l’ARN : pour identifier les erreurs dans la transcription du code génétique porté par l’ADN (en d’autres termes, le texte initial est correct, mais il est mal transcrit par la cellule) ;
• l’expression des micro-ARN, qui régulent l’expression des gènes (les micro-ARN, en s’appariant à l’ARN, peuvent neutraliser certains messages, parvenant à réguler ainsi l’expression des gènes).

Auxquels s’ajoutent, pour MAPPYACTS  :
 

• la caractérisation complète de la tumeur par l’exploration de la méthylation de l’ADN: l’ajout de « groupements méthyles » sur la molécule d’ADN modifie la façon dont la cellule transcrit les informations portées par l’ADN, par exemple en raison de modifications de la configuration spatiale de l’ADN (un peu comme la pliure d’une feuille cache certaines lettres ou certains mots, changeant ainsi le sens du texte) ;
• l’exploration des immunomodulateurs qui régulent la réponse naturelle de l’organisme à l’agression tumorale.

L’analyse de tous ces mécanismes permet d’avoir une vision des différentes étapes auxquelles une erreur peut conduire à l’apparition de cellules tumorales, puis, d’une tumeur.